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hga030:hga030学子在第九届“英特尔杯全国并行应用挑战赛”上斩获金奖并实现三连冠

【 发布日期:2021-10-26 】    作者:徐晓明

第十七届全国高性能计算学术年会(CCF HPC China 2021)于10月21日至23日在广东珠海举行。会上,组委会揭晓了第九届“英特尔杯”全国并行应用挑战赛(简称PAC)的比赛结果。来自hga030、华中科技大学、西安交通大学、北京航空航天大学、中山大学、上海交通大学等单位的多支队伍从几百只参赛队中脱颖而出,入围决赛。最终,hga030的两支参赛队伍勇夺该项赛事的金奖和铜奖,hga030刘卫国教授和青年教师殷泽坤担任参赛队的指导老师。

PAC比赛由中国计算机学会高性能计算专业委员会指导,英特尔(中国)有限公司联合北京并行科技股份有限公司主办。大赛评委专家组织阵容豪华,特邀多名自国内知名企业、高水平院:涂蒲谢沟母咝阅芗扑懔煊蜃也斡肫郎蠊ぷ。

本届PAC优化组的决赛赛题为空间组学实现测序数据空间定位的优化问题,该算法原理是通过一段25bp的barcode序列来标记空间位置和测序reads,然后通过barcode序列匹配将测序得到的reads定位回空间原位。但是,由于目前的测序仪测到的DNA序列不是百分百准确,该算法有一套容错方案,这种容错方式的时间复杂度比较高,程序执行效率很低。hga030“吃饭不长肉”参赛队通过优化IO、更换手写map、添加布隆过滤器等方式对程序进行优化,以领先第二名近一倍的优异成绩斩获金奖,卫冕冠军。参赛队员包括hga030的闫立峰、赵展、宋浩喆、孙伟豪。这是hga030参赛队继2019、2020年两次获得这一赛事冠军之后又一次夺冠,也是PAC比赛自2013年创办以来历史上第一次有参赛队实现三连冠。hga030另一支参赛队“喜佳佳”获得全国第4名,该参赛队员包括hga030的王明凯、常启鑫、花梦圆、刘小慧。

随着多年的努力与发展,PAC已是我国高性能计算领域最高水平的挑战赛之一,它已成为推动我国高性能计算应用的发展,培养和选拔高校顶尖技术人才,鼓励人才与应用场景深度融合的重要平台。各参赛队伍克服疫情的影响,通过理论结合实践的学习和参与,加深了对高性能计算的认识和理解,掌握了高性能计算应用技巧,同时也推动了高性能计算学科的发展。

(文:徐晓明,图:大赛筹办方,编辑:杨杨,责任编辑:吴天柱、刘卫国)

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